为缅怀著名爱国女教育家、社会活动家，原金陵女子大学校长、民进中央原副主席、全国妇联原副主席、江苏省原副省长吴贻芳先生，1990年10月，南京师范大学在随园校园（吴贻芳曾在此校园执掌校务23年）内设“吴贻芳纪念馆”，展示吴贻芳先生的生平事迹和实物、照片，供后人瞻仰，馆内后还增设金陵女子大学校史展室，展现吴贻芳先生在女子高等教育发展中的作用及人才培养的成就。

2000年9月，由金女大海外校友捐助20万美金、江苏省政府拨付50万人民币，对贻芳园进行了改建，总面积300多平方米。2002年吴贻芳纪念馆重新对外开放。纪念馆落成后，国家领导人彭珮云、顾秀莲，全国政协、全国妇联、民进中央、民进江苏省委、政府机关干部、社会团体、大中小学师生、中外校友、外国友人等近万人先后前来参观。

2007年南京师范大学成立“吴贻芳研究中心”，并将有关吴贻芳先生的研究成果、历史资料，集中展示于馆内。

2010年7月，民进中央授牌“吴贻芳纪念馆”为首批“民进中央会史教育基地”。 民进江苏省委也和南京师范大学协商，将“吴贻芳纪念馆”作为共建共享共用的宣传教育基地。

2015年于金陵女子大学建立100周年之际，吴贻芳网上纪念馆开通，收集了吴贻芳及金女大丰富的相关史料。

2018年4月，中共南京市委统战部授牌“吴贻芳纪念馆”为“南京市统一战线爱国主义教育基地”。2020年被设为江苏省同心教育基地、江苏民进会史教育基地。

吴贻芳纪念馆现已成为省内学生接受爱国主义教育、全国民进会员接受会史教育的重要阵地，在提升教育理念，宣传爱国思想，增进会史教育等方面都有积极影响。馆内以100多件吴贻芳的遗物和她不同时期的图片，多面展现了吴贻芳热爱祖国、追求真理、积极参与人类进步事业的高尚风范。